Báo cáo tại hội nghị, bác sĩ Nguyễn Thị Mộng Ngọc, Giám đốc Sở Y tế, Phó Trưởng Ban chỉ đạo Phòng chống dịch COVID-19 tỉnh cho biết: Công tác phòng, chống dịch COVID-19 trên địa bàn tỉnh trong năm 2020 được triển khai quyết liệt. Ngành Y tế tỉnh thành lập đội Phản ứng nhanh phòng chống dịch, xây dựng quy trình tiếp nhận, sàng lọc, cách ly, điều trị các ca nghi ngờ và mắc bệnh. Công tác truyền thông được đẩy mạnh trên các phương tiện truyền thông của tỉnh, truyền thông trực quan, trực tiếp rộng rãi trong cộng đồng, nhất là các địa điểm có nguy cơ cao. Công tác hướng dẫn biện pháp phòng, chống dịch và điều tra dịch tễ được triển khai rộng khắp đến các cơ sở y tế, thôn, xóm, hộ gia đình. Tổ chức tốt công tác cách ly y tế chống dịch với 3 cơ sở cách ly tập trung cấp tỉnh; tại mỗi huyện, thị xã, thành phố cũng thành lập cơ sở cách ly tập trung; tại Bệnh viện Đa khoa tỉnh và trung tâm y tế cấp huyện bố trí khu cách ly điều trị các ca nghi ngờ/ca nhiễm COVID-19… 
Đến nay, Phú Yên tiếp nhận cách ly, điều trị 27 trường hợp xác định bệnh (tất cả là các ca nhập cảnh từ nước ngoài), 74 trường hợp bệnh nghi ngờ được cách ly, theo dõi và điều trị tại các cơ sở y tế. Có 1.425 trường hợp cách ly tập trung, gần 2.500 trường hợp cách ly tại nhà/nơi cư trú. 
Hội nghị đã chỉ ra những khó khăn, bất cập trong quá trình thực hiện các phương án phòng chống COVID-19 thời gian qua, trong đó có biểu hiện lơ là chủ quan, chưa ý thức cao trong phòng chống dịch… từ đó đưa ra các phương án, giải pháp hiệu quả, bám sát nhu cầu thực tế. 
Phát biểu tại hội nghị, đồng chí Trần Hữu Thế ghi nhận, đánh giá cao những nỗ lực của các ngành, địa phương, người dân trên địa bàn toàn tỉnh trong công tác phòng, chống dịch, nhất là các lực lượng tuyến đầu như ngành Y tế, quân đội, công an, đội ngũ làm công tác tuyên truyền… Dự báo trong thời gian tới, dịch bệnh COVID-19 tiếp tục diễn biến phức tạp, khó lường, trên thế giới và Việt Nam đã xuất hiện biến thể mới của COVID-19 có khả năng lây lan nhanh, nguy hiểm, đặc biệt là thời điểm đón Tết Nguyên đán Tân Sửu sắp tới sẽ có nhiều người về quê ăn Tết, tham gia các lễ hội. Chủ tịch UBND tỉnh yêu cầu, trong giai đoạn hiện nay và sắp tới cần tiếp tục tăng cường công tác phòng, chống dịch COVID-19 theo chỉ đạo của Trung ương và địa phương; tăng cường thông tin tuyên truyền về nguy cơ dịch bệnh sâu rộng trong cộng đồng, không lơ là chủ quan, thực hiện nghiêm khuyến cáo 5K của Bộ Y tế; quản lý, giám sát chặt chẽ việc cách ly người nhập cảnh, nhập cảnh trái phép, người hoàn thành cách ly tập trung về địa phương; điều trị tốt các ca bệnh, thực hiện tốt biện pháp chống lây nhiễm chéo trong bệnh viện, cơ sở y tế; xử lý nghiêm các trường hợp vi phạm quy định các biện pháp phòng chống dịch... 
Dịp này, Chủ tịch UBND tỉnh trao tặng bằng khen cho 31 tập thể và 19 cá nhân đã có nhiều thành tích trong công tác phòng, chống dịch COVID-19 trong năm 2020.