Ngày 14/8/2006, Hội được đổi tên thành Hội Y học tỉnh Phú Yên theo Quyết định số 1187/QĐ-UBND của UBND tỉnh Phú Yên.
Ngày 24/7/2013, Đại hội nhiệm kỳ V(2013-2018).
- Chủ tịch Hội: Bác sĩ Huỳnh Ngọc Ấn
- Số lượng Hội viên: 481 người
- Điện thoại: 01266.78.38.97
- Địa chỉ: 73 Lạc Long Quân - Phú Lâm - Tuy Hòa - Phú Yên
- Chức năng, nhiệm vụ: Hội Y học hoạt động theo chức năng và Điều lệ Hội, góp phần cùng ngành y tế triển khai các hoạt động chăm sóc và bảo vệ sức khỏe nhân dân tỉnh nhà; động viên hội viên thực hiện đề tài nghiên cứu khoa học cấp ngành, cấp tỉnh; phối hợp với ngành tổ chức hội thảo, tập huấn khoa học cấp tỉnh và khu vực; tham gia quản lý hành nghề y dược tư nhân…